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会议预告 | 探索新数据模型:探索环境DNA数据

Linda 海洋与湿地
2024-08-11
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中国生物多样性保护与绿色发展基金会“海洋与湿地”(OceanWetlands)编辑将于北京时间2023年6月8日晚上21:00参加由国际科学理事会旗下全球开放科学云(GOSC)的工作组关于生物多样性案例的一场"探索环境DNA数据"的活动。

图源:GBIF

环境DNA(eDNA)数据是指从环境样本中提取的DNA分子信息。当生物体存在于环境中时,它们会释放DNA碎片,如皮肤细胞、毛发、粪便和体液等。通过采集环境样本(如水、土壤或空气样本),科学家可以提取和分析这些环境中存在的DNA片段。通过分析环境中的eDNA,可以检测到各种生物的存在,包括微生物、植物、动物等。eDNA数据的应用非常广泛,可以用于生物多样性监测、物种鉴定、生态系统评估以及环境监测等领域。它为科学家提供了一种非侵入性和高效的方式来了解环境中的生物多样性,并且在生态研究和保护工作中具有重要的潜力。

此次活动将于2023年6月8日当地时间15:00 – 17:00(CEST时区)举行,旨在探讨环境DNA(eDNA)和GBIF(全球生物多样性信息平台)的新数据模型的最新更新和发展。此次活动的议程包括专家演讲,分享他们在eDNA数据发布方面的见解和经验,以及讨论和社区参与环节,探讨未来eDNA数据发布的可能形式。

此次活动将由GBIF秘书处的社区和能力建设经理Mélianie Raymond主持。与会者将了解目前发布eDNA数据的实践,并参与关于未来发布工具和流程的讨论。

活动的议程安排如下(按当地时间15:00 – 17:00 CEST)

15:00:数据模型工作和背景更新,由John Wieczorek(GBIF)主讲。

15:10:发布eDNA数据的当前实践:总体描述目前可用的数据和数据发布指南,由Tobias Guldberg Frøslev(GBIF)主讲。

15:20:两位社区演讲者介绍他们在eDNA数据发布方面的经验:

(1)您分享eDNA数据通过GBIF的动机是什么?

(2)到目前为止,您分享了哪些数据?

(3)您在发布eDNA数据方面遇到了哪些挑战?由Tobias Guldberg Frøslev(GBIF)主讲。

15:45:来自OBIS社区的eDNA数据发布视角,由Saara Suominen(OBIS)主讲。

15:55:开发eDNA新发布模型的动机和社区咨询结果,由Tobias Guldberg Frøslev(GBIF)主讲。

16:05:关于新的eDNA数据发布工具的初步进展更新,由Thomas Stjernegaard Jeppesen(GBIF)主讲。

16:15:讨论环节。

16:50:总结并邀请通过提供数据集和测试数据模型和未来发布工具/流程来参与进一步的工作,由Tobias Guldberg Frøslev、Mélianie Raymond和Tim Robertson(GBIF)主讲。

此次活动还将邀请一些专家作为讨论嘉宾和会议的促进者。

这个活动将为与会者提供了解eDNA数据和GBIF新数据模型的机会,并参与讨论和未来工作的社区参与。

注册方式

https://us02web.zoom.us/webinar/register/WN_ZxDl6I0cQ3KOVbm34IQU0g

——————

【活动背景介绍】

此次活动是WorldFAIR Project系列网络研讨会的一部分。近期在生物多样性信息学界的讨论中,强调了扩大和改进基本数据模型的必要性,以更好地反映生物多样性的丰富性,并提供应对生物多样性丧失和气候变化的挑战所需的信息。

在这个项目中,该项目将征求专家成员的意见,开发一个全面包括来自全球新兴生物多样性监测项目的长期生物多样性监测数据的FAIR(可查找、可访问、互操作和可重用)数据模型,以便更容易地进行集成、共享和重复利用。咨询的目的是确定数据模型和流程的改进,进而改善达尔文核心(Darwin Core,DwC)标准及其FAIR原则的实施。

作为在FAIR原则制定之前在开放和可重复使用数据方面的领导者,GBIF在生成生物多样性科学中的FAIR数据方面发挥着影响力。通过GBIF网络动员的所有数据都是完全免费和开放访问的,所有元数据都很容易获取。然而,生物多样性社区已确定是时候重新审视GBIF的核心数据模型,以更好地实施FAIR数据集成,特别是与不断发展的数字扩展标本计划相结合。同时,满足日益增长的启用新数据类型,特别是基于DNA的数据的集成需求,并更好地连接当前未能与全球数据网络良好连接的长期生物多样性监测数据变得至关重要。通过FAIR的推荐和评估,以及作为GBIF数据模型核心的新的FAIR互操作性框架,该项目的目标是改善流程,从而帮助全球生物多样性社区实施FAIR数据标准。

FAIR数据标准是一组原则和准则,用于确保数据在科学和研究领域中的可查找性(Findable)、可访问性(Accessible)、互操作性(Interoperable)和可重用性(Reusable)。"可查找"意味着数据应该具有明确定义的标识符和元数据,以便能够轻松地找到和检索。"可访问"意味着数据应该以开放的方式提供,使任何人都能够获取和查看。"互操作性"意味着数据应该以一种结构化的格式存在,使其能够与其他数据集和工具进行无缝集成和交互操作。"可重用性"意味着数据应该具有清晰的许可和使用条款,并且应该能够在不同的上下文中被重复使用。通过采用FAIR数据标准,科学家和研究人员能够更有效地共享、集成和利用数据,促进合作和创新。

文 | Linda

编辑 | Sara

【拓展阅读】

里程碑:绿会成GBIF正式数据发布者

https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_2255307

全球生物多样性信息网络(GBIF)副总干事Tim Hirsch到访中国绿发会

http://www.cbcgdf.org/NewsShow/4937/5360.html


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